ICE (CRISPR)

Parte de uma série sobre
CRISPR
Edição de genoma - Edição de RNA
CRISPR/Cas
Variantes
Anti-CRISPR - CIRTS - CRISPR/Cpf1 - CRISPeY
CRISPR-Cas10 - CRISPR-Cas13 - CRISPR-BEST
CRISP-Disp - CRISPR-Gold - CRISPRa - CRISPRi
DIPA-CRISPR - Easi-CRISPR - FACE - Gene Cutter BRCA1 - LEAPER - Prime editing
Pro-AG - RESCUE - RLR - TALEN - ZFN
Enzimas
Cas9 - FokI - EcoRI - PstI - SmaI
HaeIII - ERT2 - Cpf1 - xCas9
Aplicações
CAMERA - ICE - Genética dirigida
Portal da Biologia
Portal da Biologia Celular
Portal da Genética

ICE, (abreviatura de Inference of CRISPR Edits), Inferência de Edições CRISPR (em português) é uma ferramenta de software livre e de código aberto que oferece análise rápida e confiável de dados de edição CRISPR.[1] Este software não requer alteração manual de configurações ou parâmetros.[2]

Operação

Basta carregar seus dados de sequenciamento Sanger no ICE para ver a frequência total indel, a frequência relativa de cada indel, uma pontuação nocaute (KO) que revela a proporção de indels capazes de gerar mutações completas de perda de função e diferenças totais entre os editados e os selvagens digite seqüências.[3]

Referências

  1. ↑ Stoner, Rich; Enzmann, Brittany L.; Holden, Kevin; Kelso, Reed; Yang, Joyce; Waite, Kelsey; Maures, Travis; Conant, David; Hsiau, Tim (14 de janeiro de 2019). «Inference of CRISPR Edits from Sanger Trace Data». bioRxiv (em inglês). 251082 páginas. doi:10.1101/251082 
  2. ↑ «Analyzing CRISPR Editing Results». GEN - Genetic Engineering and Biotechnology News (em inglês). 31 de maio de 2018. Consultado em 10 de julho de 2019 
  3. ↑ «Synthego | Full Stack Genome Engineering». www.synthego.com (em inglês). Consultado em 10 de julho de 2019 
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