Eclodiram confrontos entre as tropas paquistanesas e da al-Qaeda e outros militantes ligados por rebeldes locais e forças pró-talibã. As ações paquistanesas foram apresentadas como uma parte da guerra contra o terrorismo declarada pela administração de George W. Bush, e que tinha ligações com a guerra e a insurgência talibã no Afeganistão.[4][5]
Até esta data, os militares paquistaneses ganharam quase todas as batalhas contra os militantes. No entanto, a militância continua forte em várias partes da Khyber Pakhtunkhwa. A partir de 2009, o Exército do Paquistão está atualmente sendo treinados para uma guerra de contrainsurgência pelos governos britânico e americano.[6]
Desde o início do conflito, o Paquistão já perdeu mais de três vezes o número de seus soldados, em comparação com o número de soldados americanos mortos no Afeganistão. No entanto, a partir de Dezembro de 2008, confirmou que o número de militantes mortos pelo Exército do Paquistão chegou a marca de 6.000.[7]
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2003–2004
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2005–2006
Atentado em Londres· 2.º atentando em Londres · Atentado de Sharm el-Sheij · 2.º atentado em Bali · Atentado em Nova Deli · Atentado de Amã · Atentado de 2006 em Varanasi · Atentado de 2006 em Bombaim · Projeto de ataques em companhias aéreas transatlânticas em 2006 · Caso de terrorismo de Toronto em 2006
2007–2008
Atentados de 11 de abril de 2007 · Atentado de Ancara ·Atentado em Londres em 2007· Ataque ao Aeroporto Internacional de Glasgow · Ataque de 2007 a turistas no Iêmen · Ataque de Hyderabad · Atentado de Qahtaniya · Atentado de Carachi · Atentado de Baghlan · Atentado ao Congresso Filipino ·Atentado em Argel·Assassinato de Benazir Bhutto· Atentado de Jaipur · Atentado à embaixada dinamarquesa · Atentada à embaixada indiana · Atentado ao consulado dos Estados Unidos · Atentado à embaixada dos Estados Unidos no Iêmen · Atentado de Islamabad ·Atentados em Bombaim em 2008
2009-2013
Ataque à equipe de críquete do Sri Lanka · Ataque de 2009 a turistas no Iêmen · Atentado de Lahore · Atentado ao Hotel Pearl Continental ·Atentado de Jacarta