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— Diario sobre as observações feitas nas plantas, que se recolheram no rio Branco. 12 pags. de fol.
— Diario sobre as observações feitas nas plantas, que se recolheram no rio Madeira. 36 pags. de fol.
— Memoria sobre as palmeiras. 11 pags. de fol.
— Collecção das experiencias de tinturaria, que se fizeram nas viagem de expedição philosophica pelo rio Negro, com doze amostras de tinta em lã.
— Relação dos preparos necessarios à expedição philosophica que executou, os quaes pediu em 1786. 36 pags. de fol.
— Papeis avulsos de memorias e escriptos pertencentes à viagem, etc, 1840 pags. de fol. e 428 pags. in-4.º
— Oração latina por occazião dos annos do serenissimo senhor dom José, principe do Brazil, feita em 1779.
— Falla que fez para recitar no dia da posse do excellentissimo senhor general do Parà Martinho de Souza e Albuquerque e bispo dom frei Caetano Brandão.
— Falla que fez na noite de 19 de setembro de 1784 ao despedir-se do excellentissimo senhor Martinho de Souza e Albuquerque. 3 pags. de fol.
— Falla que fez na tarde de 2 de março de 1785 ao illustrissimo e excellentissimo senhor João Pereira Caldas, quando entrou a visital-o na villa de Barcellos. 4 pags. de fol.
— Falla que fez o mesmo no dia 4 de agosto de 1785, dia em que fazia annos. 4 pags. de fol.
— Propriedade e posse das terras do Cabo do Norte pela corôa de Portugal em 1792. 47 pags. de fol. — Foi publicada com o titulo:
— Propriedade e posse das terras do Cabo do Norte pela corôa de Portugal, deduzida dos annaes historicos do Estado do Maranhão, e documentos por onde se acham dispersas as suas prova. 1792 — Sahiu no tomo 3.º da Revista do instituto historico, pags. 389 a 421.
— Propriedade e posse de Portugal das terras cedidas aos francezes na margem boreal do rio Amazonas. 1802. 9 pags. de fol.
— Memoria ou parecer sobre a plantação dos olivaes nas terras que na villa de Coruche tinha Joaquim Rodrigues Botelho — Desta obra ha noticia no caderno das memorias particulares do doutor Alexandre Ferreira, do anno de 1783.
— Memoria sobre as matas de Portugal, dividida em tres partes e lida na academia real das sciencias no anno de 1780. 82 pags. in 4.º
— Abuso da Conchyliologia em Lisboa etc. 1781. 86 pags. in 4º — Foi tambem lida na academia real das sciencias.
— Descripção de uma planta desconhecida pelo cirurgião-mór do regimento de Alcantara. 41 pags. in 4º — Diz o autor da Noticia destes