Porina

Porina específica de sacarose
Porina F trimer, E.Coli.

As porinas são proteínas com estrutura de barril beta que abrangem toda a espessura de uma membrana celular e funcionam como um poro através do qual pode ocorrer a difusão passiva de certas moléculas.[1][2] Ao contrário de outras proteínas de transporte membranar, as porinas são grandes o suficiente para permitir a difusão passiva através delas, ou seja, atuam como canais que são específicos para diferentes tipos de moléculas. Estão presentes na membrana externa das bactérias Gram-negativas e também em algumas Gram-positivas do grupo Mycolata (actinomicetos que contêm ácido micólico), nas mitocôndrias e nos cloroplastos.

A descoberta das porinas foi atribuída a Hiroshi Nikaido, a quem foi dado o apelido de "o porinólogo".[3]

Estrutura

As porinas são compostas por cadeias β, que estão, geralmente, ligadas por voltas beta no lado citoplasmático e por longos laços de aminoácidos no outro. As cadeias β dispõem-se de modo antiparalelo e formam um tubo cilíndrico, chamado barril β.[4] A composição de aminoácidos das cadeias β das porinas é peculiar, pois os resíduos de aminoácidos polares e não polares são alternantes. Isto significa que os resíduos não polares ficam virados para fora e interagem com a membrana lipídica apolar, enquanto os resíduos polares estão orientados para dentro, voltados para o interior do barril beta, para interagirem com o canal aquoso.

O canal da porina está parcialmente bloqueado por um laço (o olho do poro), que se projeta para dentro da cavidade. Em geral, encontra-se entre as cadeias 5 e 6 de cada barril, e define o tamanho dos solutos que podem atravessar o canal. Está revestido quase exclusivamente por aminoácidos carregados, dispostos a cada lado do canal, criando um campo elétrico transversal através do poro. O olho do poro tem um excedente local de cargas negativas por ter quatro resíduos de ácido glutâmico e sete de ácido aspártico (juntamente com um resíduo de histidina, duas lisinas e três argininas, que não o compensam), e é parcialmente compensado pela ligação de dois iões cálcio. Pensa-se que esta disposição assimétrica da molécula influencia a seleção das moléculas que podem passar através do canal.[5]

Funções celulares

Nas bactérias Gram-negativas, a membrana interna é a principal barreira de permeabilidade, enquanto a membrana externa contém porinas, que a tornam muito permeável a moléculas de aproximadamente 1500 daltons. As moléculas de tamanho médio ou carregadas que necessitam de ser transportadas através da membrana movem-se através das porinas.

As porinas controlam tipicamente a difusão de pequenos metabolitos como açúcares, iões e aminoácidos.

As porinas são quimicamente seletivas, transportando apenas um grupo de compostos (por exemplo, carboidratos[6]), ou podem mesmo ser específicas para um único composto[7]. Os antibióticos beta-lactâmicos e a fluoroquinolona devem passar através das porinas para atingir os seus alvos nas bactérias Gram-negativas[8][9]. As bactérias podem desenvolver resistência a estes antibióticos através de mutações no Gene que codifica as porinas.

Outras "porinas"

Existem outras proteínas que formam poros ou canais nas membranas que contêm o nome porina, mas que são completamente distintas. As nucleoporinas são proteínas que facilitam o transporte através dos poros nucleares do envoltório nuclear eucariota, sendo, portanto, distintas das porinas de tipo bacteriano e classificadas separadamente. As aquaporinas são outro tipo de proteínas que formam canais aquosos nas membranas das células, também totalmente diferentes das bacterianas, com uma estrutura formada por hélices alfa.

Referências

  1. B. K. Jap and P. J. Walian. Structure and functional mechanism of porins. APS. Phisiological Reviews. [1] Arquivado em 2016-04-04 no Wayback Machine
  2. MeshName - Porins
  3. Klebba PE (2005). «The porinologist». Journal of Bacteriology. 187 (24): 8232–6. PMC 1317029Acessível livremente. PMID 16321927. doi:10.1128/JB.187.24.8232-8236.2005 
  4. Schirmer T (1998). «General and specific porins from bacterial outer membranes». Journal of Structural Biology. 121 (2): 101–9. PMID 9615433. doi:10.1006/jsbi.1997.3946 
  5. Branden and Tooze, Introduction to Protein Structure, second edition
  6. EMBL-EBI. Carbohydrate-selective porin OprB (IPR007049)
  7. Transporter classification database
  8. Pagès, Jean-Marie; James, Chloë E.; Winterhalter, Mathias (dezembro de 2008). «The porin and the permeating antibiotic: a selective diffusion barrier in Gram-negative bacteria». Nature Reviews Microbiology (em inglês). 6 (12): 893–903. ISSN 1740-1526. doi:10.1038/nrmicro1994 
  9. Jean-Marie Pagès, Chloë E. James & Mathias Winterhalter. The porin and the permeating antibiotic: a selective diffusion barrier in Gram-negative bacteria. Nature Reviews Microbiology 6, 893-903 (dezembro de 2008). doi:10.1038/nrmicro1994. [2]